Esimerkki passiivisesta DNA:sta. Kampelatutkijan koulutusta.

Esim. ATP-entsyymin tuotantoon solu lukee ATP6V1B1-jaksoa, josta se valmistaa seitsemää erilaista silmukointivarianttia. Tiettyä silmukointivarianttia modifioimalla (vaihtoehtoinen silmukointi sekä RNA-editointi) se rakentaa valmiin mRNA:n, joka käännetään proteiiniksi. Kysymys kuuluu: Missä ovat valmistusohjeet tuon mRNA:n rakentamiseksi? Samaa DNA:ta kun käytetään useiden muidenkin RNA-molekyylien valmistamiseksi.

DNA on optimaalisesti järjesteltyä kielellistä informaatiota, jota lukemalla solu voi valmistaa pre-mRNA-molekyylin. Tätä modifioidaan monin eri tavoin ennen kuin valmis mRNA päästetään käännösprosessiin varsinaista proteiinia varten.

Jotta solun RNA-polymeraasi tietäisi, mistä kohdasta genomia transkriptio alkaa, niin jonkinlainen aloituskohta transkriptiolle on oltava. Kerro Kampelatutkija, mikä toimii aloituskohtana.

Jotta solun RNA-polymeraasi tietäisi, mihin transkriptio päättyy, niin jonkinlainen lopetusmarkkeri transkriptiolle on oltava. Kerro Kampelatutkija, mikä toimii lopetuskohtana. Mihin DNA:n lukeminen päättyy?

Jotta solun RNA-polymeraasi tietäisi, kuinka aktiivisesti ko. DNA-jaksoa luetaan, niin tällekin löytyy ohjaus. Mikä säätelee transkription vahvuutta eli aktiivisuutta.

Toisinaan transkriptiota tulee hillitä. Mitkä tekijät säätelevät tätä mekanismia?

https://www.ensembl.org/Homo_sapiens/Gene/Summary?g=ENSG00000116039;r=2:70935900-70965431

Vinkkejä, joilla pääset tiedonhaun alkuun:

transcription factor, promoter, enhancer, suppressor, methylation, CpG, epigenetic, microRNA
14102
Äänestä

Muut lukivat myös

Vastaukset 14

Vanhimmat
Aloittaja

Tässä yksi esimerkki siitä, miten hermostoon liittyvät tapahtumat ohjaavat DNA:n lukemista transkriptioon. Kyse on siis aivotoiminnasta, muistista ja oppimisesta.

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5846851/

Kerro Kampelatutkija, mikä on CH3, eli metyyliryhmä ja mitkä mekanismit ohjaavat niiden sitoutumista oikeille paikoilleen. Ja kuinka paljon CH3-ryhmien sijainti vaikuttaa proteiinituotantoon (transkription aloitus/lopetuskohtaan, vahvistukseen ja hillitsemiseen, vaihtoehtoiseen silmukointiin ja RNA-editointiin)?

Äänestä

Ja tämä todistaa sen että juuri sinun jumalasi olisi olemassa ja vielä luonut jotain miten?

On se kumma ettei teissä kretuissa ole edes niin älykkäitä ihmisiä että osaisivat edes kirjoittaa oikeasta aiheesta oikealla palstalla... :(

1Äänestä

Kampelatutkija voittanut jokaisen teidän debatin hölmö..

Äänestä

Geeni koostuu säätelyalueesta ja RNA:ta koodittavasta alueesta. Geenin luenta RNA:ksi tapahtuu RNA-polymeraasin toimesta. Alkaessaan geenin luennan RNA-polymeraasi sitoutuu koodittavan alueen eteen. Säätelyalue säätelee sitä, kuinka usein RNA-polymeraasi lukee geenin. Säätelyalueita sijaitsee lähellä RNA-synteesin aloituskohtaa (promoottori) tai etäämmällä RNA-synteesin aloituskohdasta (tehostajajaksot). Geeniä säätelevät DNA:han sitoutuvat säätelyproteiinit (mm. estäjäproteiini l. repressori, transkriptiotekijä). Osaa geeneistä luetaan kaikissa olosuhteissa (ylläpitogeenit), osaa vain tietyissä tilanteissa tai solutyypeissä. Bakteereille tyypillisiä rakenteita ovat geeniryhmät eli operonit, jossa useita geenejä on ryhmittynyt yhden säätelyalueen perään. Tumallisten organismien geenit muodostuvat paloista, eksoneista, joiden välissä on ei-koodittavia introneita. RNA-synteesin jälkeen intronit silmukoidaan pois ja eksonit yhdistetään. Tämä mahdollistaa vaihtoehtoisen silmukoinnin, eli yksi geeni voi tuottaa useita erilaisia proteiineja. Bakteereilla DNA ja ribosomit sijaitsevat solulimassa, joten proteiinisynteesi voi käynnistyä jo transkription aikana. Tumallisilla organismeilla lähetti-RNA:n transkriptio ja silmukointi tapahtuvat tumassa, minkä jälkeen lähetti-RNA kuljetetaan solulimaan proteiinisynteesiä varten.

Tämä Helsingin yliopiston molekyylibiotieteiden koulutusohjelman pääsykoeen mallivastaus tarjoaa vastaukset kyselyvimmaasi. On aina mukava olla avuksi kun haluat kouluttautua molekyylibiologian alalla.

https://www.helsinki.fi/sites/default/files/atoms/files/by_2015_molekyylibiotiede_valintakoe_mallivastaus_tehtava1.pdf

2Äänestä
  • Pitäisikö hänelle vielä kertoa pääsykoeopiskelun aloitusta edeltävät perustiedot geenin aloitus- ja lopetuskohdista. Meuhkaa aloituksessa niistä kuin yksin olisi keksinyt tuonkin asian.

    Äänestä

  • Aloittaja

    Kerro ensin, mikä on promoottori. En päästä sinua tentistä läpi, ennen kuin vastaat kysymyksiin oikein ja mekanismi tulee selvitetyksi kaikille lukijoille.

    Äänestä

  • Onko tämä nyt ymmärrettävä näin?
    ROT, joka on opastanut oman väitteensä mukaan mikrobiologian tutkijoita oikeaan tulkintaan genomin toiminnasta, pitää molekyylibiologian koulutusohjelman pääsykoekysymyksiä vaikeina haasteina... ja samalla hän pitää itseään vähintäänkin huippututkijoiden veroisena ja ainakin osin parempana asiantuntijana.

    Siis pääsykoekysymyksiä...Haloo. Onko ROT:lla enää ketään kotona?

    Äänestä

  • Aloittaja

    Kerro, mitä ovat transkriptiotekijät ja mitkä tekijät ja mekanismit vaikuttavat niiden sitoutumiseen transkription aloitus- ja lopetuskohtiin.

    Äänestä

  • RaamattuOnTotuus kirjoitti:

    Kerro ensin, mikä on promoottori. En päästä sinua tentistä läpi, ennen kuin vastaat kysymyksiin oikein ja mekanismi tulee selvitetyksi kaikille lukijoille.

    Mistä tentistä? Sinä et pääsisi läpi edes pääsykokeista. Se on edellytys sille, että pääsisit ensimmäiseen tenttiisi.

    Promoottorin on DNA:sta riippuvaisen RNA-polymeraasin sitoutumiskohta, josta RNA-synteesi yleensä alkaa

    Äänestä

  • Aloittaja

    Joudut siis käyttämään jo melko iäkästä ja tiedoiltaan vanhentunutta yliopiston pääsykokeen mallivastausta, koska raukka et itse kykene kertomaan, miten transkriptiota säädellään. Olihan tämä toki arvattavissa.

    Äänestä

  • Aloittaja

    Anonyymi kirjoitti:

    Mistä tentistä? Sinä et pääsisi läpi edes pääsykokeista. Se on edellytys sille, että pääsisit ensimmäiseen tenttiisi.

    Promoottorin on DNA:sta riippuvaisen RNA-polymeraasin sitoutumiskohta, josta RNA-synteesi yleensä alkaa

    Kerro, mikä on promoottori. Mistä se rakentuu ja koostuu? Voiko promoottorin rakenne ja paikka vauhtua?

    Äänestä

  • RaamattuOnTotuus kirjoitti:

    Joudut siis käyttämään jo melko iäkästä ja tiedoiltaan vanhentunutta yliopiston pääsykokeen mallivastausta, koska raukka et itse kykene kertomaan, miten transkriptiota säädellään. Olihan tämä toki arvattavissa.

    Vastaus oli vain osoitus siitä, miten alkeellisella tasolla kysymyksesi ovat. Tuo tietotaso vaaditaan ennen kuin pääsee edes aloittamaan molekyylibiologian opintoja.
    Mutta ethän sinä raukka tajunnut satiiria. Siltu uskot kykeneväsi neuvomaan huipuututkijoita.

    Noloa ROT noloa.

    Äänestä

Aloittaja

Ei vaan tule oikeaa vastausta. Pitänee tehdä aiheesta uusi aloitus ja näyttää, miten pihalla Kampelatutkija on.

Äänestä
  • Olet ottanut nekkuusi joka ainoassa aloituksessa, mihin kampelantutkkija on vastannut.

    Ps.
    DNA sanelee fenotyypin rajat.
    Informaatio voi lisääntyä.
    Evoluution mekanimsi tunnetaan.
    Genomin rappeutuminen ei ole ollut primäärinen tekijä ainoassakaan sukupuutossa.
    Ihmissuku on yli 200 000 vuotta vanha.
    Nooan tulva on uskonnollinen satu.
    Puhuvia aaseja on vain kaatumaseurojen puhujalavoilla.

    Äänestä

Kommentoi aloitusta


RaamattuOnTotuus kirjoitti:

Esim. ATP-entsyymin tuotantoon solu lukee ATP6V1B1-jaksoa, josta se valmistaa seitsemää erilaista silmukointivarianttia. Tiettyä silmukointivarianttia modifioimalla (vaihtoehtoinen silmukointi sekä RNA-editointi) se rakentaa valmiin mRNA:n, joka käännetään proteiiniksi. Kysymys kuuluu: Missä ovat valmistusohjeet tuon mRNA:n rakentamiseksi? Samaa DNA:ta kun käytetään useiden muidenkin RNA-molekyylien valmistamiseksi.

DNA on optimaalisesti järjesteltyä kielellistä informaatiota, jota lukemalla solu voi valmistaa pre-mRNA-molekyylin. Tätä modifioidaan monin eri tavoin ennen kuin valmis mRNA päästetään käännösprosessiin varsinaista proteiinia varten.

Jotta solun RNA-polymeraasi tietäisi, mistä kohdasta genomia transkriptio alkaa, niin jonkinlainen aloituskohta transkriptiolle on oltava. Kerro Kampelatutkija, mikä toimii aloituskohtana.

Jotta solun RNA-polymeraasi tietäisi, mihin transkriptio päättyy, niin jonkinlainen lopetusmarkkeri transkriptiolle on oltava. Kerro Kampelatutkija, mikä toimii lopetuskohtana. Mihin DNA:n lukeminen päättyy?

Jotta solun RNA-polymeraasi tietäisi, kuinka aktiivisesti ko. DNA-jaksoa luetaan, niin tällekin löytyy ohjaus. Mikä säätelee transkription vahvuutta eli aktiivisuutta.

Toisinaan transkriptiota tulee hillitä. Mitkä tekijät säätelevät tätä mekanismia?

https://www.ensembl.org/Homo_sapiens/Gene/Summary?g=ENSG00000116039;r=2:70935900-70965431

Vinkkejä, joilla pääset tiedonhaun alkuun:

transcription factor, promoter, enhancer, suppressor, methylation, CpG, epigenetic, microRNA

Anonyymi
5000

Ilmoita asiaton sisältö

  • Sisältää materiaalia, joka on loukkaavaa, herjaavaa, rasistista, uhkailevaa tai ahdistelevaa.

  • Materiaali sisältää nimiä, yhteystietoja tai muita henkilökohtaisia tietoja. Julkisuuden henkilöistä, julkisissa viroissa toimivista ihmisistä sekä yritysten vastuuhenkilöistä saa keskustella työhön liittyen. Myös yksityiselämään liittyvistä asioista voi keskustella siltä osin, kuin niistä on julkisesti kerrottu.

  • Sisältää lapsille haitallista tai heiltä kiellettyä materiaalia. Seksuaalinen sisältö on sallittua aiheeseen tarkoitetuilla palstoilla, joiden ikäraja on 18 vuotta.

  • Lainvastaista sisältöä voi olla mm. yksityiselämää loukkaavan tiedon levitys, kiihottaminen kansanryhmää vastaan, laiton uhkaaminen, alaikäisiin liittyvä seksuaalinen sisältö/grooming, petokset, identiteettivarkaudet, kunnianloukkaukset ja tekijänoikeusrikkomukset.

  • Sisältö ei liity palstan tai keskusteluketjun aiheeseen.

  • Viesti ei ole suomea tai ruotsia (pl. International Forums), se sisältää mainontaa, se sisältää tekijänoikeuksin suojattua materiaalia, se on massapostitus tai jokin muu syy.

Jaa keskustelu